Un milieu anaérobie est un milieu où il n'y a pas de dioxygène (O2).
Une bactérie est dite "anaérobie stricte" lorsqu'elle ne se développe que dans un milieu sans oxygène. Dans ce cas, l'oxygène est de plus un poison.
Une bactérie est dite "anaérobie facultative" ou "aéro-anaérobie" lorsqu'elle peut se développer en présence d'oxygène (respiration aérobie) ou en absence d'oxygène (respiration anaérobie ou fermentation).