Un microorganisme est un Être microscopique, invisible à l’œil nu.

Les microorganismes sont classés en 4 grandes familles :

• les bactéries
  
• les levures
  
• les moisissures
  
• les virus.

La Matière Organique ou MO est obtenue par calcination à 550°C du résidu sec d'un produit.

Les moisissures sont des êtres vivants unicellulaire, champignons, microscopiques 

Le mot moisissure désigne l'apparition d'un «champignon microscopique, de couleur verdâtre ou blanchâtre, qui se développe, à la faveur de l'humidité».

Elles se reproduisent et se propagent par des spores.

La Matière Sèche ou MS d'un échantillon est obtenue par évaporation de l'eau dans une étuve à 105°C jusqu'à l'obtention d'un poids constant.

Volume de gaz ramené aux conditions standards de pression et de température (0°C, 1 bar).

Le Pouvoir Calorifique Inférieur ou PCI désigne la quantité de chaleur dégagée par la combustion d'une unité de masse de produit (1 kg) ou de volume (Nm³).

Le pH est un paramètre essentiel du pilotage d'un réacteur de méthanisation.

L'écosystème anaérobie est très sensible aux variations du pH et en particulier sur les populations de microorganismes méthanogènes.

Le pH optimum d'un digesteur se situe au-delà de la valeur 7.

Après avoir traversé le digesteur, le substrat est envoyé dans le post-digesteur dans lequel la substance organique dégradable est complètement décomposée.

Fosse à l'intérieur de laquelle les effluents d'élevage sont mélangés avec les autres matières organiques provenant de l'exploitation (déchets de culture, herbe…) ainsi que les co-substrats, matières organiques provenant de l'extérieur de l'exploitation (déchets verts …).

Dispositif pour l'évacuation de l'eau de condensation de la conduite de biogaz